50年一遇的年初持续性低温寒害给南方林业造成了巨大损失，淇澳红树林也未能幸免。尽管在寒潮到来之前，保护区采取了苗木塑料薄膜覆盖等防寒措施，却仍然无法抵抗罕见低温的损害。此次寒害使红树林受灾面积逾3000亩，其中1200亩海桑成林受害严重，目前尚未发芽，已确定死亡的红树幼林达360亩，总共经济损失估计约1200万元以上。灾情发生后，保护区立即着手调查灾情，部署一系列抗灾复产措施，积极展开灾后红树林重建工作，目前第一阶段恢复重建工作进展顺利，已取得阶段工作成果，情况如下：

一、组织全国权威专家到保护区调研红树林灾后复产工作，召开由科研机构、高等院校和省政协委员的专家出席的红树林保护和发展研讨会，及时听取专家们对红树林灾后恢复以及保护和发展的意见和建议。

二、加强灾后红树林生长监测工作，密切观察树木随着气温回升而表现出来的受害症状。受害严重的1200亩海桑林枝条目前尚未发芽，现一直跟踪观察该红树林消长变化情况；同时已对冻死的部分红树枯枝进行修剪，防止枝条继续枯死。

三、引进136000株红树苗对被冻死的红树幼苗进行及时补种。从海南购得56000株无瓣海桑苗，对已被冻死的在滩涂种植的360亩红树林幼树进行补种；从湛江等地购入80000株耐寒红树—秋茄的胚轴苗对已被冻死的去年在林下栽种的不耐寒的红海榄苗进行更替补种，继续进行先锋树种改造工作。

四、重建红树林树种园。从海南新引种木果楝、尖叶卤蕨、拉关木、莲叶桐、小花老鼠簕、滨海猫尾木、玉蕊、海漆、银叶树、白骨壤、水黄皮、海芒果等16个红树种类栽种于树种园，重新构建红树植物基因库。

五、筹备建立红树林保护基金，组织社会各界为保护红树林献爱心。已有企业和个人踊跃捐款近7万元，添柏岚香港贸易有限公司珠海代表处还组织了由200名员工参加的义工活动为保护区义务种植红树。